Запомните, у вас здесь все должно быть хорошо: правильные макеты документов: счета, счета-фактуры, накладные.
Все документы с первого же дня раскладывайте по заранее купленным папкам. Папок этих у вас должно быть сразу штук 8. Поверьте, это не много, это минимум! Обязательно приучите себя делать это с самого начала, иначе, буквально через пару месяцев, вы будете тонуть в бумагах, а самые ценные бумаги потеряются.
У вас должен быть человек (пусть хоть приходящий или удаленный), который должен контролировать весь документооборот! Как правило, это приходящий бухгалтер.
Если у вас ну очень маленький бизнес, с небольшим количеством продаж в день, то здесь вам подойдет сервис moedelo.org.
Моя статья о том, как нельзя делать:
Моя попытка купить интернет-магазин интимных товаров.